按照美軍的管理程式，總統是它們最大的頭，美國總統是美國三軍總司令，都得聽他的。美國總統下設國防部長，國防部長屬于文官，國防部長負責管理美軍各軍種。總統下面還有一個國家安全委員會，成員包括總統，副總統，國防部長，國務卿，中情局局長，國家安全顧問等，1947年7月組建。
美國國防部成立于1945年，是美國總統領導美軍的最高權力機構。美國總統做為三軍統帥有很多事要做，平時的管理由國防部負責。國防部負責制定統一的國防政策和國防戰略，設一個文職部長，屬于實權人物，第一副部長、四個副部長、六個助理部長、兩個部長長助理、監察長、法律顧問等組成。國防部下轄參謀長聯席會議、陸軍部、海軍部、空軍部以及九大聯合司令部組成。
國防部長通過三個軍種部長對全軍實施行政領導，通過參謀長聯席會議主席對全軍實施作戰指揮。
參謀長聯席會議屬于國防部長直接領導的參謀機構，由參聯會主席、副主席、陸軍參謀長、海軍作戰部長、空軍參謀長、陸軍司令等人組成。參謀長聯席會議主席是美軍現役最高長官，但無權指揮軍隊，不過他可以在總統、國防部長領導下對各部隊下達上級作戰命令。參謀長聯席會議主席通常代表軍方，但是，他不過就是總統、國防部長、國家安全委員會下轄的一個參謀機構。
美軍陸海空三軍部長屬于國防部長直接下屬，他們是平時管理美國軍隊的頭頭，但是，沒有作戰指揮權。
由此可見，真正有權力管理，指揮美國軍隊的是總統，國防部長也是在總統的指揮下工作。平時軍隊管理由各軍種各負其責，戰時由總統領導下的國防部長，國家安全委員會負責，由參謀長聯席會議主席在總統、國防部長領導下下達作戰命令。
因此，美國軍隊都要聽總統的命令，但是，總統也要按規定程式走。
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