據EurekAlert!網站2月25日消息，芝加哥大學部的研究人員利用超級計算機首次開發出了一個完整的SARS-CoV-2病毒體的新的多尺度粗粒度模型，包括其核心遺傳物質和病毒外殼，該模型為科學家提供了利用該病毒“漏洞”的新方法的可能性，相關研究于2020年11月發表在Biophysical Journal上。
該項研究的早期結果顯示了病毒表面的刺突蛋白是相互連接的，當一種蛋白質移動時，另一種蛋白質也會相應移動。刺突蛋白的這種協同運動有助于了解冠狀病毒如何探索和檢測潛在宿主細胞的ACE2受體。
該團隊開發的整體模型首先建立了SARS-CoV-2病毒的四個主要結構元素的原子模型：刺突、膜、核衣殼和包膜蛋白。然后對這些原子模型進行模擬和簡化，以生成完整的粗粒度模型。
該團隊利用了德克薩斯大學部奧斯汀分校的學高級計算中心（TACC）運營的Frontera超級計算機上生成的刺突蛋白的開態和閉態的全原子動力學資訊，以及其他數據。Frontera系統由美國國家科學基金會（NSF）資助。
Frontera提供給研究人員的這類資訊有助于理解病毒感染的基本機制，還有助于設計更安全、更好的藥物來治療和預防這種疾病，
https:http://www.eurekalert.org/pub_releases/2021-02/uota-fcc022521.php
來源：大陸科訊
編輯：Naomi
