隨著對性功能障礙研究的深入，發現部分治療不滿意的患者潛意識中存在性欲壓抑，這往往與他們早期的經歷有關，并能在成年后較長時間內影響其性功能，
性功能障礙可能跟性意識
有一個患者原發性性欲低下，小時候父母不和，經常吵鬧，但接連生了11個孩子。病人認為他的父母“就像豬一樣，過著沒有感情的性生活”，從那以后，他一直默默壓抑著父母遺傳下來的“動物般的性欲”，對性生活完全沒有興趣，還有一個性欲低下的女病人，年輕的時候和媽媽一起去醫院。當她經過產房時，她聽到了產婦的叫喊，她媽媽告訴她，生孩子是女人最痛苦的事，婚后，她對性生活很感興趣。
潛意識是一種無意識的精神生活，由人的生理欲望和沖動組成，具有很強的心理能量儲存，這種儲存總是試圖滲透到意識中，引起意識的興奮和緊張，有一個陽痿患者，20歲性活躍，有勃起和遺精。但是，有了女朋友之后，這些現象就消失了，原來他對母親的感情很深。他十幾歲的時候，母親出事去世，他很難過，他的妻子和母親在行為和談話上都很相似，雖然他沒有意識到兩者之間的聯系，但潛意識里，患者找到了失散已久的母親，戀母情結抑制了他的勃起功能和性欲，導致陽痿。
人的欲望和控制欲望的沖突往往會引起一種無處不在的恐懼，即心理學上的“焦慮”。焦慮可以產生多種心理防御機制，其中壓抑是最重要的防御機制，它可以使心理沖突幾乎完全隱藏，阻止我們意識到它的存在。一個病人在家里排在最后，一切靠媽媽。婚后一切由妻子處理，蜜月的時候，他也有性欲，心理分析表明，他的內心沒有丈夫意識和男人意識，他的婚姻關系意識有一些別人沒有的內涵：l今天的家庭是他童年家庭的延續，他感同身受過去對母親的依戀，對他來說，妻子不是婚床上的性伴侶，而是一個依賴的對象，一個不能‘亂倫’的母親，他意識中固有的“亂倫恐懼”扼殺了他的性欲和早期本能，
當心理防御機制變得突出時，它會支配一個人的人格和發展，損害他或她的生理功能，這些心理矛盾的性質和強度取決于童年的教養和父母的態度，解決潛意識阻抗的方法是識別抑郁情緒，引導其進入意識領域，從而達到消除抑郁的目的，因此，長期未治愈的性功能障礙患者，應到性心理治療門診或大型醫院的精神心理科尋求治療，以盡快緩解無法言說的痛苦。
性功能障礙還跟這些因素有關
1.生物因素
性功能障礙可能由多種原因引起，如遺傳、健康狀況、激素水平、年齡、疾病(包括慢性病、神經精神疾病、內分泌疾病、生殖器官疾病)等，吸毒、長期酗酒或吸毒也可能有性功能障礙。
2.精神和心理因素
心理和心理因素對性功能有突出的影響，包括錯誤的性觀念、過去性經歷的影響、環境因素、人際關系緊張以及各種外界因素引起的負面情緒，
3.文化因素
由于宗教文化背景的影響，有些人對性生活有偏見(比如認為“一滴精十滴血”)，他們認為性交會失去活力，主觀上放棄或減少性活動，容易造成性壓抑，
