性病的癥狀大多表現在生殖器，如梅毒、淋病、尖銳濕疣等。但一些性傳播疾病也可以發生在生殖器甚至全身以外的一些器官，如艾滋病，容易導致誤診誤治，
淋球菌口腔和咽喉疾病
主要是口交引起的。淋球菌性口腔疾病的常見癥狀是硬腭上出現贅生物，表面凹凸不平，呈菜花狀突起；咽喉疾病的常見癥狀是咽喉腫脹和扁桃體腫大，如果按上干治療基本沒有效果，
淋球菌眼病
性傳播疾病有三種：成人型、兒童型和嬰兒型，成年型多為患者用手揉眼睛時感染，兒童型多為父母或保姆感染，嬰兒型多為分娩時產生丘疹所致。普琪瑞琪主要表現為眼瞼發紅，結膜充血，眼球表面形成片狀假膜，起初，可以看到紅色水樣或血樣分泌物。紅腫減輕后，膿性分泌物會從眼瞼裂流出，分泌物中有大量淋球菌。
直腸綜合征
一種性傳播疾病是以排便疼痛、瘙癢、大便帶粘液為主要癥狀的一組疾病，多見于有直腸性交史的同性戀者。少數患者在生殖道感染淋球菌并擴散到直腸。病原體多為淋球菌、梅毒螺旋體、沙眼衣原體和單純皰疹病毒，
淋病性關節炎
在淋球菌性關節炎患者中，40%-60%是由淋球菌感染引起的，其特征是發病前關節不對稱、多關節、皮膚紅斑膿皰或手足腱鞘炎，80%的患者可從其宮頸、直腸、尿道或咽部培養淋球菌，
性傳播疾病
這種疾病是由性傳播疾病的病原體通過血液傳播到肝臟引起的，有些患者表現為心肌心包炎和肺炎，
常見癥狀為右上腹劇烈疼痛、壓痛、反彈痛，伴有發熱、下腹痛等盆腔炎，但急腹癥無肝腫大、黃疸，其病原體為淋球菌、沙眼衣原體或支原體，