楊過與郭芙成婚并生下一子陽頂天，耶律叛變成為武林盟主，后被陽頂天打敗后自刎。郭襄解救文天祥失敗，范瑤下毒害死韓千葉，方湘君出家為尼改名滅絕師太，陽頂天迎娶成昆師妹柳芯茹，宋遠橋10年才做一俠義之事。

華山一別，郭襄遍游天下尋找楊過，終南山古墓尋隱者不遇，偶遇張君寶，夜聽覺遠大師吟誦九陽真經。

襄陽大戰十余年后，蒙元再次圍困襄陽，郭靖夫婦堅守抗敵，郭襄、破虜已到而立之年。

此時，老五絕已經作古，楊過雖避而不見郭襄，卻將玄鐵劍與君子淑女劍送至襄陽，以助黃蓉刀劍計劃。

襄陽城破前，黃蓉將九陰真經與兵法藏于桃花島，把楊過所贈玄鐵劍與君子淑女劍鑄成倚天劍與屠龍刀，并將藏寶圖藏于刀劍之內。

襄陽城破，郭靖夫婦與郭破虜以身殉國，屠龍刀遺失戰場，耶律齊投降蒙古，郭芙突圍，躲于桃花島，郭襄身在川西躲過一劫。

南帝弟子武修文和朱子柳逃往西域昆侖山，創立朱武連環莊。

郭襄繼續游歷江湖，勤練武功，幫助義軍抗擊蒙元。曾反對義軍毫無準備解救文天祥導致文丞相提前被殺，對義軍不滿。

小龍女死，楊過與郭芙結為夫婦，并生下一子，取名楊破天。

襄陽城破后數年，南宋滅亡。明教開始崛起，明教圣火令丟失，殷天正出走明教，創立天鷹教。石教主傳位于衣銹，屠龍刀與圣火令被波斯商人所得，并送與波斯明教總壇。

郭襄得知楊過與郭芙成婚，難破情關，出家創立峨眉派，并收一西域女子為徒，起名風陵。張君寶改名張三豐，在武當修行。

耶律齊在蒙元朝廷幫助下成為武林盟主。

楊破天長大成人改名陽頂天，去波斯尋回屠龍刀及圣火令，受到賞識被任命為中原明教教主，衣銹退位。

陽頂天將白駝山改名光明頂，打敗三渡，天鷹教回歸。陽頂天打敗耶律齊，耶律齊自刎而死。

張三豐創立武當派，開始拜壇收徒，11歲的宋遠橋拜于門下。

陽頂天打敗小昭的阿公韓老英雄，20年后，小昭的父親韓千葉來光明頂尋仇。

成昆收10歲的謝遜為徒，陽頂天解救柳嘯天，結識其女柳芯茹及徒弟成昆，并與成昆結為知己。

陽頂天迎娶成昆師妹柳芯茹，成昆懷恨參加喜宴。

郭襄古稀之年去世，傳位于風陵師太，并告訴倚天屠龍秘密。張三豐聽聞百損道人去世，以為玄冥神掌失傳。

謝遜出師，不明底細地被成昆讓其加入明教，受封為金毛獅王。

翌年方湘君拜風陵為師，日后改名滅絕師太。

黛綺絲從波斯來到明教光明頂，受封紫衫龍王。黛綺絲代陽頂天與前來尋仇的韓千葉水底比武，陽頂天收黛綺絲為義女。黛綺絲與韓千葉成婚。

成昆與師妹柳芯茹密道幽會氣死陽頂天，柳芯茹自殺，成昆發誓要殲滅明教，并投靠蒙元，屠龍刀與圣火令再次遺失。

殷天正帶領天鷹教脫離明教，黛綺絲破教而出，楊逍代理明教教主，明教分裂。

謝遜從西域回到中原，成昆殺其全家一十三口。

張三豐八十歲時，宋遠橋救一跳井寡婦，終于又做了件讓人等的心焦、只有十年才做一次的行俠仗義之事。

楊逍與峨眉派孤鴻子比武，將倚天劍棄在地上，并說如廢銅廢鐵一般，孤鴻子氣死，倚天劍被路人拾得交于汝陽王。

方湘君心傷師兄孤鴻子之死，正式出家為尼，改名滅絕，開始仇恨明教。

次年，謝遜奪得七傷拳譜，四處殺人，留名成昆，逼其現身。成昆通過蒙元朝廷施壓進入少林，并拜空見為師，改名圓真。

空見為謝遜打死。范遙暗戀黛綺絲被拒后，因愛生恨，下毒毒死韓千葉，美其名曰尋找失蹤的陽頂天，毀容進入汝陽王府，化名苦頭陀。

風陵師太去世，滅絕師太成為峨眉派新掌門，尋訪楊逍決心為師兄報仇，并從汝陽王府中將倚天劍取回。

丐幫幫主史火龍修練降龍十八掌方法不對，致自己傷身，攜妻深山采藥，終南山中偶遇黃衫女楊瑤琴剛剛出生。

張三豐90歲，倚天屠龍記的大幕正式拉開！